Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DENRO43583 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DENRO43583 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DENRO43583 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DENRO43583 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms