Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TO15178 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TO15178 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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