Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLGNO14967 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLGNO14967 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLGNO14967 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLGNO14967 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLGNO14967 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLGNO14967 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLGNO14967 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLGNO14967 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLGNO14967 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLGNO14967 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLGNO14967 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms