Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TSPAN4O14817 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TSPAN4O14817 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TSPAN4O14817 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TSPAN4O14817 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TSPAN4O14817 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPAN4O14817 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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