Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAK1Q9UPV9 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms