Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms