Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP35Q9P2H5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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