Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms