Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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