Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE2TQ9NPD8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms