Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSU72Q9NP77 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms