Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIN28AQ9H9Z2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms