Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
CHMP4AQ9BY43 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms