Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms