Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms