Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFHD1Q9BUP0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms