Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM79Q9BSE2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms