Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms