Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGIP1Q9BQI5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms