Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DUSP9Q99956 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP9Q99956 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms