Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms