Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIC2Q96JB3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms