Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms