Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RUNDC1Q96C34 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RUNDC1Q96C34 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms