Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRG4Q92954 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms