Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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RABGGTAQ92696 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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RABGGTAQ92696 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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RABGGTAQ92696 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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RABGGTAQ92696 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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RABGGTAQ92696 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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RABGGTAQ92696 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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RABGGTAQ92696 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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