Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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