Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX73

C16orf89, UPF0764 protein C16orf89, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf89Q6UX73 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C16orf89Q6UX73 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms