Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FBXO38Q6PIJ6 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms