Protein–RNA interactions for Protein: Q5JST6

EFHC2, EF-hand domain-containing family member C2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC2Q5JST6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFHC2Q5JST6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms