Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C3orf38Q5JPI3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms