Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms