Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTXN3Q4LDR2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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