Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UVSSAQ2YD98 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms