Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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