Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECM1Q16610 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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