Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMD5Q16401 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMD5Q16401 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMD5Q16401 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMD5Q16401 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMD5Q16401 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMD5Q16401 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMD5Q16401 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMD5Q16401 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMD5Q16401 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMD5Q16401 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms