Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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E2F4Q16254 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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E2F4Q16254 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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E2F4Q16254 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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E2F4Q16254 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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E2F4Q16254 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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E2F4Q16254 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F4Q16254 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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