Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CCDC6Q16204 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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