Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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TAF11Q15544 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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TAF11Q15544 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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TAF11Q15544 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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TAF11Q15544 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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TAF11Q15544 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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TAF11Q15544 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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TAF11Q15544 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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TAF11Q15544 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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TAF11Q15544 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TAF11Q15544 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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