Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GAPVD1Q14C86 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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