Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NR1D2Q14995 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms