Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RASGRF1Q13972 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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