Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms