Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTAN1Q13813 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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