Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1A4Q13733 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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