Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL1Q13616 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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