Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2DQ13557 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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