Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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FOXE3Q13461 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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