Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGCGQ13326 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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